飲用水管理條例只監督供公眾飲用供水系統之水源及水質，並未監督私人飲用水井，環保主管機關並未獲授權定期前往查驗水質。    
因此設立水井的井主，若做為飲用水需自行負責與維護管理井水的安全。
建議於開始用水前需做全面性的水質檢查，此外建議每年定期檢查、不定期檢查與建立水質紀錄。
因為對人體健康有影響的污染物可以是微生物的污染，例如：大腸桿菌群、總菌落數;也有可能是無機化學製品例如：鉛、硝酸鹽或硫酸鹽;或是有機化學製品例如：殺蟲劑、農藥和揮發性有機溶劑。
至於影響口感與其他感官之污染物包括鐵、錳、銅、鋅、硫酸鹽、酚類、陰離子界面活性劑、氯鹽、氨氮、總硬度和總溶解固體量。